Esta historia trata sobre la vida de Yotsuba, una chica de 6 años que es energética, curiosa, alegre y bastante extraña, y vive con su padre. Yotsuba desconoce muchas cosas que la mayoría de los chicos de su edad normalmente conocen, como las escaleras automáticas, los timbres de las puertas, los aires acondicionados, etc, lo que causa malentendidos y situaciones muy cómicas donde Yotsuba aprende cada vez un poco más sobre el mundo.